Projekt utworzenia specjalistycznego Jagiellońskiego Parku i Inkubatora Technologii (Parku LifeScience) ukierunkowanego ściśle na branżę life science został zainicjowany przez Władze Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie w 2003 r. Pierwsze prace nad projektem podjęto w Centrum Innowacji Transferu Technologii i Rozwoju Uniwersytetu (CITTRU), jednostce uczelnianej odpowiedzialnej za wspieranie przedsiębiorczości na Uniwersytecie Jagiellońskim. Wstępna strategia przedsięwzięcia uzyskała aprobatę Władz uczelni, które ostatecznie zdecydowały o przyspieszenia prac nad projektem, powołując 24 czerwca 2004 roku spółkę uniwersytecką pod nazwą Jagiellońskie Centrum Innowacji Sp. z o.o. (JCI) i powierzyły jej zarządzanie inwestycją.

Pierwotne założenia projektu, zostały rozszerzone i aktualne plany Spółki zakładają rozwinięcie kompleksowej działalności w obszarze life science, w ramach której, poza wynajmem infrastruktury (laboratoriów), oferowany jest również szeroki zakres usług komplementarnych.

We wrześniu 2005 roku Spółka pozyskała środki finansowe, w wysokości 50 mln zł dla pierwszego etapu inwestycji budowy budynku Parku LifeScience Główną ich część stanowiła dotacja unijna, a pozostałe fundusze zapewnił Uniwersytet Jagielloński oraz bank PKO BP SA.

Po ukończeniu w listopadzie 2008 roku prac nad pierwszym budynkiem kompleksu, Jagiellońskie Centrum Innowacji podjęło dalsze prace związne z rozbudową Parku LifeScience. Efektem było pozyskanie ponad 125 miliionów złotych dofinansowania na budowę BioInkubatora (budynek 2.) i Parku Technologicznego II (budynek 3.). Projekt zakłada, że oba obiekty zostaną oddane do użytku pod koniec 2011 roku.